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超过五年的亏损余额不允许弥补
企业所得税法第十八条规定，企业纳税年度发生的亏损，准予向以后年度结转，用以后年度的所得弥补，但结转年限最长不得超过5年。
在纳税人多次发生年度亏损的情况下，其亏损可以连续用从亏损年度的次年起5年内的所得弥补。在纳税人既有盈利年度又有亏损年度的情况下，根据税法规定，亏损弥补的最长年限为5年，在5年内，不论是盈利，还是亏损，都作为实际弥补年限计算。先亏先补，按顺序计算弥补期。超过5年弥补期仍未弥补完的，则不能再用以后年度的应纳税所得额弥补，只能在税后弥补或用盈余公积金弥补。
减免税收入不得用于弥补应税亏损
企业所得税法实施条例第十条规定，企业所得税法所称亏损，指企业将每一纳税年度的收入总额减除不征税收入、免税收入和各项扣除后小于零的数额。此条款明确规定企业免税所得包括不征税收入不得用于弥补亏损。
应税所得不得弥补减免税所得项目亏损
企业的应税项目所得也不得用于弥补减征、免征所得税项目亏损，只能用以后年度减免收入或所得额来弥补。《国家税务总局关于做好2009年度企业所得税汇算清缴工作的通知》（国税函[2010]148号）规定，企业取得的免税收入、减计收入以及减征、免征所得额项目，不得弥补当期及以前年度应税项目亏损；当期形成亏损的减征、免征所得额项目，也不得用当期和以后纳税年度应税项目所得抵补。这条规定要求，企业取得的免税项目应该单独核算，应税项目与免税项目不能盈亏相抵。而企业会计利润是综合计算的，没有区分应税项目与免税项目，纳税申报表同样未单独体现应税项目所得与优惠项目所得。因此，计算应税项目的应纳税所得额时，应在会计利润总额的基础上调减免税项目所得，不管免税项目是盈利还是亏损都要作全额调减，计算公式为：应税项目调整后所得＝利润总额－免税项目所得。
境内盈利不可抵减境外亏损
境内盈利不可抵减境外亏损，境外应税所得可弥补境内亏损。企业所得税法规定，企业在汇总计算缴纳企业所得税时，其境外营业机构的亏损不得抵减境内营业机构的盈利，但境外营业机构的应税所得可弥补境内亏损。境外亏损和境外所得首先需区分为直接来源于境外的所得和间接来源于境外的所得两类，因为我国企业所得税法对这两类所得采取了不同的计税办法，即直接抵免所得税法与间接抵免所得税法。企业间接来源于境外的所得指企业从其直接或者间接控制的外国企业分得的来源于中国境外的股息、红利等权益性投资收益。由于被投资企业发生的亏损，投资企业不能抵免，因此，间接来源于境外的所得不可能出现亏损。
核定征收亏损不得弥补
《国家税务总局关于印发〈企业所得税核定征收办法〉（试行）的通知》（国税发[2008]30号）第六条规定，采用应税所得率方式核定征收企业所得税的，应纳所得税额计算公式如下：应纳所得税额＝应纳税所得额×适用税率。而在应税收入的确认上，《国家税务总局关于企业所得税核定征收若干问题的通知》（国税函[2009]377号）规定，应税收入额等于收入总额减去不征税收入和免税收入后的余额。用公式表示为：应税收入额＝收入总额－不征税收入－免税收入，其中，收入总额为企业以货币形式和非货币形式从各种来源取得的收入。由此可见，实行企业所得税核定征收的纳税人，其以前年度应弥补而未弥补的亏损不能在核定征收年度弥补。但在以后转换为查账征收年度时，在政策规定的期限内仍可继续弥补亏损。
被投资企业亏损不能在投资方扣除
《国家税务总局关于企业所得税若干问题的公告》（国家税务总局公告2011年第34号）第五条第二款规定，被投资企业发生的经营亏损，由被投资企业按规定结转弥补；投资企业不得调整减低其投资成本，也不得将其确认为投资损失。
上市公司资本公积金不得用于弥补亏损
中国证监会发布的《上市公司监管指引第1号——上市公司实施重大资产重组后存在未弥补亏损情形的监管要求》（以下简称监管指引）规定，公司资本公积金不得用于弥补亏损、不得采用资本公积金转增股本同时缩股方式弥补亏损。
对于上市公司因实施重组事项可能导致长期不能弥补亏损，进而影响公司分红和公开发行证券的情形，监管指引规定了四方面的监管要求：一是相关上市公司应当遵守公司法规定，公司的资本公积金不得用于弥补公司的亏损；二是相关上市公司不得采用资本公积金转增股本同时缩股以弥补公司亏损的方式规避上述法律规定；三是相关上市公司应当在临时公告和年报中充分披露不能弥补亏损的风险并作出特别风险提示；四是相关上市公司在实施重大资产重组时，应当在重组报告书中充分披露全额承继亏损的影响并作出特别风险提示。
一般性合并、分立前的亏损不得结转弥补
根据《财政部、国家税务总局关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》（财税[2009]59号）和《国家税务总局关于发布〈企业重组业务企业所得税管理办法〉的公告》（国家税务总局公告2010年第4号）的规定，重组适用一般性税务处理的，被合并企业的亏损不得在合并企业结转弥补；企业分立相关企业的亏损不得相互结转弥补。主要规定了以下4种情况：
1.适用一般性税务处理的合并，被合并企业的亏损不得在合并企业结转弥补；
2.适用一般性税务处理的分立，相关企业的亏损不得相互结转弥补；
3.适用特殊性税务处理的合并，可由合并企业弥补的被合并企业亏损的限额＝被合并企业净资产公允价值×截至合并业务发生当年年末国家发行的最长期限的国债利率；
4.适用特殊性税务处理的分立，被分立企业未超过法定弥补期限的亏损额可按分立资产占全部资产的比例进行分配，由分立企业继续弥补。
